La Jama Masjid est la grande Mosquée de Sikri. Elle se trouve à l'extrémité sud-ouest du site. Fermée d'un haut mur, elle possède une cour intérieure de 111 sur 139 m et abrite la tombe de Salim Chisti originellement en grès rouge, et recouverte plus tard de marbre blanc. La porte principale La Sublime Porte, ou Buland Darwaza, mesure 40 m de haut et commémore la victoire d'Akbar sur le Goujerat en 1575.